中国科学院沈阳应用生态研究所成立于1954年，是以林业、农业、环境科学为基础的综合性应用生态学研究机构。现有森林生态与林业生态工程、土壤生态与农业生态工程、污染生态与环境生态工程3个研究中心、森林生态与保育重点实验室（中国科学院）、1个国地联合实验室、3个院级实验室、11个省级实验室和专业技术创新中心。研究所在不同地带、不同类型地区建有12个野外站，包括4个国家站(同为院CERN站)、1个院级站、3个所级站和4个与国家林草局共建站。研究所还拥有东北地区最大的生物标本馆以及被誉为“大城市中小森林”之称的沈阳树木园。研究所面向国家生态文明建设的重大战略需求——以碳中和、黑土地保护、国家生态安全等为研究目标，针对现代农林业可持续发展和生态环境建设中亟需解决的重大科技问题，瞄准国际应用生态学发展前沿，在森林生态与林业生态工程、土壤生态与农业生态工程、污染生态与环境生态工程领域开展基础性、战略性和前瞻性研究。完善和创新应用生态学理论、方法和技术体系；聚焦退化生态系统恢复-重建与生态安全、黑土地保护-利用与粮食安全、污染环境治理-改善与低碳绿色发展；为东北工农业现代化和新型城镇化提供生态与环境保障，为生态文明-美丽中国建设提供科技支撑。